Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA6P23280 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA6P23280 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA6P23280 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA6P23280 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA6P23280 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CA6P23280 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA6P23280 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA6P23280 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA6P23280 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA6P23280 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA6P23280 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA6P23280 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA6P23280 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA6P23280 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA6P23280 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA6P23280 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CA6P23280 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA6P23280 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CA6P23280 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CA6P23280 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA6P23280 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA6P23280 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA6P23280 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA6P23280 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA6P23280 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA6P23280 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA6P23280 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA6P23280 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA6P23280 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA6P23280 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA6P23280 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA6P23280 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA6P23280 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA6P23280 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA6P23280 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA6P23280 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA6P23280 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA6P23280 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA6P23280 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CA6P23280 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA6P23280 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA6P23280 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA6P23280 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CA6P23280 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA6P23280 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA6P23280 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA6P23280 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA6P23280 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA6P23280 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA6P23280 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA6P23280 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA6P23280 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA6P23280 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA6P23280 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA6P23280 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA6P23280 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA6P23280 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA6P23280 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA6P23280 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA6P23280 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA6P23280 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA6P23280 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA6P23280 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA6P23280 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA6P23280 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA6P23280 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CA6P23280 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA6P23280 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA6P23280 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA6P23280 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA6P23280 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA6P23280 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA6P23280 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA6P23280 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA6P23280 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA6P23280 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CA6P23280 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA6P23280 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA6P23280 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA6P23280 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA6P23280 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA6P23280 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA6P23280 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA6P23280 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA6P23280 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA6P23280 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA6P23280 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA6P23280 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA6P23280 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA6P23280 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CA6P23280 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CA6P23280 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA6P23280 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA6P23280 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA6P23280 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA6P23280 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA6P23280 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA6P23280 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA6P23280 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms