Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXA5P20719 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA5P20719 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA5P20719 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA5P20719 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms