Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB5AP20339 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB5AP20339 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB5AP20339 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB5AP20339 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms