Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA2P20248 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA2P20248 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNA2P20248 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA2P20248 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA2P20248 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA2P20248 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms