Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH2P19022 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH2P19022 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH2P19022 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH2P19022 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH2P19022 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH2P19022 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH2P19022 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH2P19022 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH2P19022 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH2P19022 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH2P19022 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH2P19022 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH2P19022 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH2P19022 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH2P19022 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH2P19022 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH2P19022 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH2P19022 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH2P19022 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH2P19022 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH2P19022 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH2P19022 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH2P19022 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH2P19022 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH2P19022 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH2P19022 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH2P19022 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH2P19022 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH2P19022 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH2P19022 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH2P19022 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH2P19022 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH2P19022 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH2P19022 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH2P19022 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH2P19022 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH2P19022 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH2P19022 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH2P19022 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH2P19022 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH2P19022 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH2P19022 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH2P19022 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH2P19022 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH2P19022 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH2P19022 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH2P19022 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH2P19022 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH2P19022 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH2P19022 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH2P19022 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH2P19022 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH2P19022 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH2P19022 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH2P19022 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH2P19022 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH2P19022 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH2P19022 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH2P19022 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH2P19022 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH2P19022 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH2P19022 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH2P19022 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH2P19022 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH2P19022 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH2P19022 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH2P19022 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH2P19022 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH2P19022 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH2P19022 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH2P19022 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH2P19022 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH2P19022 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH2P19022 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH2P19022 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH2P19022 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH2P19022 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH2P19022 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH2P19022 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH2P19022 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH2P19022 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH2P19022 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH2P19022 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH2P19022 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH2P19022 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH2P19022 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH2P19022 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH2P19022 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH2P19022 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH2P19022 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH2P19022 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH2P19022 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH2P19022 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH2P19022 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH2P19022 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH2P19022 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH2P19022 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH2P19022 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH2P19022 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms