Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCLP18206 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCLP18206 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCLP18206 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCLP18206 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCLP18206 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCLP18206 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCLP18206 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCLP18206 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCLP18206 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCLP18206 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCLP18206 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCLP18206 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VCLP18206 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCLP18206 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCLP18206 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCLP18206 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCLP18206 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCLP18206 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCLP18206 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VCLP18206 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VCLP18206 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VCLP18206 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCLP18206 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCLP18206 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCLP18206 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCLP18206 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCLP18206 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VCLP18206 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCLP18206 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCLP18206 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VCLP18206 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VCLP18206 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCLP18206 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCLP18206 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VCLP18206 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCLP18206 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCLP18206 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCLP18206 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCLP18206 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCLP18206 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCLP18206 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCLP18206 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCLP18206 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCLP18206 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VCLP18206 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCLP18206 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCLP18206 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCLP18206 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCLP18206 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCLP18206 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCLP18206 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCLP18206 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCLP18206 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCLP18206 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCLP18206 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCLP18206 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCLP18206 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCLP18206 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCLP18206 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCLP18206 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VCLP18206 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCLP18206 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCLP18206 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCLP18206 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCLP18206 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VCLP18206 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCLP18206 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCLP18206 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCLP18206 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCLP18206 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VCLP18206 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCLP18206 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCLP18206 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCLP18206 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCLP18206 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCLP18206 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCLP18206 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCLP18206 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCLP18206 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCLP18206 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCLP18206 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCLP18206 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCLP18206 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCLP18206 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms