Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFRAP16234 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDGFRAP16234 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDGFRAP16234 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFRAP16234 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFRAP16234 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFRAP16234 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDGFRAP16234 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFRAP16234 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms