Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRAFP15056 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRAFP15056 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRAFP15056 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRAFP15056 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRAFP15056 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRAFP15056 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRAFP15056 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAFP15056 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAFP15056 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAFP15056 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAFP15056 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAFP15056 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAFP15056 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAFP15056 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRAFP15056 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRAFP15056 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRAFP15056 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRAFP15056 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAFP15056 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRAFP15056 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRAFP15056 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRAFP15056 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRAFP15056 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRAFP15056 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRAFP15056 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRAFP15056 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRAFP15056 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRAFP15056 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRAFP15056 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRAFP15056 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRAFP15056 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRAFP15056 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRAFP15056 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRAFP15056 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRAFP15056 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRAFP15056 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRAFP15056 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRAFP15056 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRAFP15056 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRAFP15056 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRAFP15056 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRAFP15056 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRAFP15056 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRAFP15056 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRAFP15056 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRAFP15056 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRAFP15056 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRAFP15056 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRAFP15056 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRAFP15056 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRAFP15056 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRAFP15056 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRAFP15056 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRAFP15056 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRAFP15056 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRAFP15056 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRAFP15056 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRAFP15056 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRAFP15056 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRAFP15056 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRAFP15056 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRAFP15056 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRAFP15056 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRAFP15056 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRAFP15056 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRAFP15056 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRAFP15056 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRAFP15056 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRAFP15056 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRAFP15056 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRAFP15056 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRAFP15056 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRAFP15056 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRAFP15056 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRAFP15056 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRAFP15056 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRAFP15056 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRAFP15056 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRAFP15056 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRAFP15056 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRAFP15056 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRAFP15056 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRAFP15056 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRAFP15056 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRAFP15056 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRAFP15056 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRAFP15056 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAFP15056 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAFP15056 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAFP15056 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRAFP15056 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRAFP15056 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRAFP15056 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRAFP15056 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRAFP15056 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BRAFP15056 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRAFP15056 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRAFP15056 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRAFP15056 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms