Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP2P12643 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP2P12643 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP2P12643 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP2P12643 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP2P12643 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP2P12643 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP2P12643 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP2P12643 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP2P12643 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP2P12643 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP2P12643 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP2P12643 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMP2P12643 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMP2P12643 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP2P12643 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP2P12643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP2P12643 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP2P12643 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP2P12643 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BMP2P12643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP2P12643 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP2P12643 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP2P12643 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP2P12643 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP2P12643 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP2P12643 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP2P12643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP2P12643 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP2P12643 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP2P12643 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP2P12643 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP2P12643 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP2P12643 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP2P12643 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP2P12643 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP2P12643 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP2P12643 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP2P12643 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP2P12643 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP2P12643 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP2P12643 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP2P12643 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP2P12643 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP2P12643 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP2P12643 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP2P12643 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP2P12643 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP2P12643 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP2P12643 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP2P12643 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP2P12643 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP2P12643 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP2P12643 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP2P12643 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP2P12643 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP2P12643 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP2P12643 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP2P12643 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP2P12643 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP2P12643 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP2P12643 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP2P12643 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP2P12643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP2P12643 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP2P12643 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP2P12643 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP2P12643 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP2P12643 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP2P12643 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP2P12643 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP2P12643 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP2P12643 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP2P12643 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP2P12643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP2P12643 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP2P12643 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP2P12643 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP2P12643 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP2P12643 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP2P12643 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP2P12643 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP2P12643 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP2P12643 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP2P12643 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP2P12643 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP2P12643 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP2P12643 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BMP2P12643 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
BMP2P12643 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP2P12643 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP2P12643 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP2P12643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP2P12643 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP2P12643 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP2P12643 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP2P12643 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP2P12643 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP2P12643 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP2P12643 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms