Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTHFD1P11586 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTHFD1P11586 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFD1P11586 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFD1P11586 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFD1P11586 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFD1P11586 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms