Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM236CP0DP71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM236CP0DP71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM236CP0DP71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM236CP0DP71 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms