Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM58BPP0C7Q3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM58BPP0C7Q3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM58BPP0C7Q3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM58BPP0C7Q3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM58BPP0C7Q3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM58BPP0C7Q3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM58BPP0C7Q3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM58BPP0C7Q3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM58BPP0C7Q3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms