Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN19P0C672 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN19P0C672 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN19P0C672 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN19P0C672 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN19P0C672 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN19P0C672 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms