Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFPTP0C1Z6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFPTP0C1Z6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TFPTP0C1Z6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFPTP0C1Z6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFPTP0C1Z6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFPTP0C1Z6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms