Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACAA1P09110 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACAA1P09110 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACAA1P09110 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACAA1P09110 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA1P09110 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms