Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1AP08908 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1AP08908 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTR1AP08908 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTR1AP08908 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1AP08908 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1AP08908 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms