Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD55P08174 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD55P08174 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD55P08174 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD55P08174 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD55P08174 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD55P08174 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD55P08174 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD55P08174 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD55P08174 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD55P08174 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD55P08174 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD55P08174 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD55P08174 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD55P08174 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD55P08174 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD55P08174 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD55P08174 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD55P08174 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD55P08174 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD55P08174 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD55P08174 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD55P08174 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD55P08174 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD55P08174 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD55P08174 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD55P08174 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD55P08174 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD55P08174 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD55P08174 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD55P08174 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD55P08174 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD55P08174 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD55P08174 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD55P08174 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD55P08174 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD55P08174 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD55P08174 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD55P08174 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD55P08174 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD55P08174 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD55P08174 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD55P08174 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD55P08174 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD55P08174 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms