Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NGFRP08138 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGFRP08138 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGFRP08138 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGFRP08138 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGFRP08138 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGFRP08138 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGFRP08138 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGFRP08138 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGFRP08138 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGFRP08138 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGFRP08138 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGFRP08138 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGFRP08138 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGFRP08138 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGFRP08138 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGFRP08138 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGFRP08138 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGFRP08138 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGFRP08138 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGFRP08138 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGFRP08138 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGFRP08138 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGFRP08138 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NGFRP08138 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NGFRP08138 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NGFRP08138 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NGFRP08138 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NGFRP08138 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NGFRP08138 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGFRP08138 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGFRP08138 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGFRP08138 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGFRP08138 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGFRP08138 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGFRP08138 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGFRP08138 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGFRP08138 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGFRP08138 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGFRP08138 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGFRP08138 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGFRP08138 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NGFRP08138 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGFRP08138 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NGFRP08138 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGFRP08138 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGFRP08138 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGFRP08138 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGFRP08138 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGFRP08138 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGFRP08138 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NGFRP08138 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGFRP08138 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NGFRP08138 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGFRP08138 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGFRP08138 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGFRP08138 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGFRP08138 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGFRP08138 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NGFRP08138 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGFRP08138 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGFRP08138 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NGFRP08138 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGFRP08138 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGFRP08138 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NGFRP08138 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NGFRP08138 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NGFRP08138 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGFRP08138 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGFRP08138 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGFRP08138 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGFRP08138 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NGFRP08138 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NGFRP08138 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NGFRP08138 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NGFRP08138 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NGFRP08138 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NGFRP08138 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NGFRP08138 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NGFRP08138 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NGFRP08138 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NGFRP08138 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGFRP08138 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NGFRP08138 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGFRP08138 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NGFRP08138 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NGFRP08138 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGFRP08138 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NGFRP08138 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NGFRP08138 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGFRP08138 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGFRP08138 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGFRP08138 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NGFRP08138 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NGFRP08138 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NGFRP08138 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NGFRP08138 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NGFRP08138 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NGFRP08138 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NGFRP08138 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms