Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCGP05129 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCGP05129 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCGP05129 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCGP05129 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCGP05129 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCGP05129 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms