Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD74P04233 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD74P04233 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD74P04233 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD74P04233 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD74P04233 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD74P04233 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD74P04233 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD74P04233 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD74P04233 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD74P04233 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD74P04233 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD74P04233 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD74P04233 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD74P04233 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD74P04233 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD74P04233 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD74P04233 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD74P04233 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD74P04233 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD74P04233 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD74P04233 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD74P04233 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD74P04233 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD74P04233 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD74P04233 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD74P04233 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD74P04233 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD74P04233 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD74P04233 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD74P04233 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD74P04233 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD74P04233 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD74P04233 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD74P04233 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD74P04233 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD74P04233 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD74P04233 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD74P04233 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD74P04233 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD74P04233 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD74P04233 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD74P04233 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD74P04233 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD74P04233 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD74P04233 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD74P04233 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD74P04233 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD74P04233 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD74P04233 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD74P04233 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD74P04233 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD74P04233 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD74P04233 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD74P04233 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD74P04233 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD74P04233 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD74P04233 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD74P04233 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD74P04233 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD74P04233 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD74P04233 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD74P04233 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD74P04233 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD74P04233 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD74P04233 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD74P04233 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD74P04233 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD74P04233 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD74P04233 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD74P04233 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD74P04233 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD74P04233 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD74P04233 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD74P04233 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD74P04233 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD74P04233 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD74P04233 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD74P04233 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD74P04233 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD74P04233 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD74P04233 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD74P04233 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD74P04233 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD74P04233 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD74P04233 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD74P04233 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD74P04233 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD74P04233 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD74P04233 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD74P04233 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD74P04233 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD74P04233 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD74P04233 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD74P04233 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD74P04233 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD74P04233 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD74P04233 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD74P04233 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD74P04233 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms