Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFF1P04155 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFF1P04155 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFF1P04155 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFF1P04155 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFF1P04155 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFF1P04155 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFF1P04155 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFF1P04155 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFF1P04155 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFF1P04155 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFF1P04155 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFF1P04155 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFF1P04155 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFF1P04155 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFF1P04155 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFF1P04155 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFF1P04155 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFF1P04155 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFF1P04155 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFF1P04155 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFF1P04155 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFF1P04155 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFF1P04155 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFF1P04155 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFF1P04155 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFF1P04155 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFF1P04155 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFF1P04155 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFF1P04155 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFF1P04155 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFF1P04155 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFF1P04155 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFF1P04155 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFF1P04155 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFF1P04155 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFF1P04155 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFF1P04155 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFF1P04155 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFF1P04155 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFF1P04155 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFF1P04155 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFF1P04155 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFF1P04155 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFF1P04155 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF1P04155 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF1P04155 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF1P04155 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF1P04155 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFF1P04155 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFF1P04155 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFF1P04155 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF1P04155 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF1P04155 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF1P04155 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF1P04155 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFF1P04155 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFF1P04155 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFF1P04155 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFF1P04155 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF1P04155 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF1P04155 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF1P04155 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFF1P04155 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFF1P04155 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFF1P04155 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFF1P04155 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFF1P04155 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF1P04155 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF1P04155 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF1P04155 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF1P04155 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF1P04155 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF1P04155 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF1P04155 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF1P04155 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF1P04155 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF1P04155 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF1P04155 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFF1P04155 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF1P04155 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF1P04155 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF1P04155 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF1P04155 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF1P04155 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF1P04155 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF1P04155 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF1P04155 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms