Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MMP1P03956 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MMP1P03956 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MMP1P03956 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MMP1P03956 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MMP1P03956 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
MMP1P03956 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MMP1P03956 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MMP1P03956 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MMP1P03956 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MMP1P03956 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
MMP1P03956 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MMP1P03956 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MMP1P03956 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MMP1P03956 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MMP1P03956 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MMP1P03956 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MMP1P03956 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MMP1P03956 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MMP1P03956 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MMP1P03956 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MMP1P03956 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MMP1P03956 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MMP1P03956 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MMP1P03956 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MMP1P03956 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MMP1P03956 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MMP1P03956 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MMP1P03956 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MMP1P03956 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
MMP1P03956 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MMP1P03956 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
MMP1P03956 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MMP1P03956 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
MMP1P03956 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MMP1P03956 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MMP1P03956 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MMP1P03956 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MMP1P03956 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MMP1P03956 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MMP1P03956 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MMP1P03956 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MMP1P03956 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MMP1P03956 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MMP1P03956 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MMP1P03956 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MMP1P03956 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MMP1P03956 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MMP1P03956 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MMP1P03956 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MMP1P03956 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MMP1P03956 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MMP1P03956 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MMP1P03956 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MMP1P03956 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MMP1P03956 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MMP1P03956 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MMP1P03956 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MMP1P03956 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MMP1P03956 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MMP1P03956 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MMP1P03956 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MMP1P03956 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MMP1P03956 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MMP1P03956 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MMP1P03956 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP1P03956 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP1P03956 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP1P03956 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP1P03956 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP1P03956 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP1P03956 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP1P03956 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MMP1P03956 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MMP1P03956 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MMP1P03956 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MMP1P03956 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP1P03956 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP1P03956 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP1P03956 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP1P03956 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP1P03956 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MMP1P03956 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MMP1P03956 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MMP1P03956 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MMP1P03956 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MMP1P03956 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MMP1P03956 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MMP1P03956 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MMP1P03956 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MMP1P03956 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MMP1P03956 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MMP1P03956 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MMP1P03956 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MMP1P03956 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MMP1P03956 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MMP1P03956 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MMP1P03956 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MMP1P03956 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MMP1P03956 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms