Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C9P02748 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C9P02748 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9P02748 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9P02748 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9P02748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9P02748 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9P02748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9P02748 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9P02748 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9P02748 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9P02748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9P02748 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9P02748 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9P02748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C9P02748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9P02748 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9P02748 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9P02748 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C9P02748 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9P02748 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9P02748 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9P02748 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9P02748 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9P02748 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9P02748 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9P02748 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9P02748 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9P02748 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9P02748 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9P02748 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9P02748 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9P02748 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9P02748 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9P02748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9P02748 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9P02748 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9P02748 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9P02748 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9P02748 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9P02748 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9P02748 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C9P02748 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9P02748 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9P02748 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9P02748 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9P02748 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9P02748 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9P02748 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9P02748 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9P02748 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9P02748 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9P02748 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9P02748 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9P02748 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9P02748 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9P02748 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9P02748 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9P02748 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9P02748 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9P02748 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9P02748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9P02748 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9P02748 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9P02748 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9P02748 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9P02748 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9P02748 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9P02748 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9P02748 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9P02748 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9P02748 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9P02748 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9P02748 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9P02748 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9P02748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9P02748 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9P02748 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C9P02748 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9P02748 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C9P02748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9P02748 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9P02748 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9P02748 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9P02748 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9P02748 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9P02748 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C9P02748 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C9P02748 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C9P02748 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9P02748 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9P02748 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C9P02748 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C9P02748 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9P02748 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9P02748 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C9P02748 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9P02748 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9P02748 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C9P02748 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms