Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD4P01730 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD4P01730 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD4P01730 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CD4P01730 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD4P01730 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD4P01730 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD4P01730 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD4P01730 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD4P01730 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD4P01730 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD4P01730 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD4P01730 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD4P01730 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD4P01730 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD4P01730 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD4P01730 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD4P01730 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD4P01730 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD4P01730 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD4P01730 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD4P01730 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD4P01730 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD4P01730 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD4P01730 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD4P01730 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD4P01730 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD4P01730 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD4P01730 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD4P01730 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD4P01730 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD4P01730 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD4P01730 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CD4P01730 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CD4P01730 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CD4P01730 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD4P01730 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CD4P01730 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CD4P01730 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD4P01730 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CD4P01730 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD4P01730 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD4P01730 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD4P01730 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CD4P01730 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD4P01730 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD4P01730 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD4P01730 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD4P01730 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD4P01730 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CD4P01730 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CD4P01730 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD4P01730 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD4P01730 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD4P01730 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD4P01730 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD4P01730 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD4P01730 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD4P01730 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD4P01730 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD4P01730 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD4P01730 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD4P01730 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD4P01730 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD4P01730 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD4P01730 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD4P01730 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD4P01730 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD4P01730 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD4P01730 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD4P01730 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD4P01730 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD4P01730 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD4P01730 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD4P01730 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD4P01730 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD4P01730 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD4P01730 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CD4P01730 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CD4P01730 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD4P01730 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD4P01730 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD4P01730 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CD4P01730 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CD4P01730 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CD4P01730 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CD4P01730 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CD4P01730 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CD4P01730 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD4P01730 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD4P01730 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD4P01730 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD4P01730 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CD4P01730 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CD4P01730 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD4P01730 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CD4P01730 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD4P01730 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD4P01730 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD4P01730 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms