Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTL6AO96019 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTL6AO96019 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTL6AO96019 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTL6AO96019 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms