Protein–RNA interactions for Protein: O95858

TSPAN15, Tetraspanin-15, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN15O95858 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN15O95858 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN15O95858 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN15O95858 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN15O95858 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN15O95858 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN15O95858 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN15O95858 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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