Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MATN4O95460 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MATN4O95460 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MATN4O95460 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MATN4O95460 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MATN4O95460 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MATN4O95460 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MATN4O95460 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MATN4O95460 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MATN4O95460 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MATN4O95460 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MATN4O95460 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MATN4O95460 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MATN4O95460 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MATN4O95460 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MATN4O95460 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MATN4O95460 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MATN4O95460 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MATN4O95460 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MATN4O95460 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MATN4O95460 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MATN4O95460 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MATN4O95460 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MATN4O95460 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MATN4O95460 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MATN4O95460 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MATN4O95460 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MATN4O95460 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MATN4O95460 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MATN4O95460 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MATN4O95460 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MATN4O95460 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MATN4O95460 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MATN4O95460 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MATN4O95460 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MATN4O95460 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MATN4O95460 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MATN4O95460 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MATN4O95460 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MATN4O95460 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MATN4O95460 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MATN4O95460 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MATN4O95460 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MATN4O95460 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MATN4O95460 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MATN4O95460 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MATN4O95460 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MATN4O95460 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MATN4O95460 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MATN4O95460 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MATN4O95460 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MATN4O95460 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MATN4O95460 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MATN4O95460 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MATN4O95460 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MATN4O95460 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MATN4O95460 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MATN4O95460 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MATN4O95460 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MATN4O95460 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MATN4O95460 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MATN4O95460 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MATN4O95460 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MATN4O95460 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MATN4O95460 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MATN4O95460 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MATN4O95460 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MATN4O95460 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MATN4O95460 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MATN4O95460 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MATN4O95460 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MATN4O95460 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MATN4O95460 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MATN4O95460 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MATN4O95460 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MATN4O95460 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MATN4O95460 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MATN4O95460 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MATN4O95460 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MATN4O95460 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MATN4O95460 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MATN4O95460 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MATN4O95460 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MATN4O95460 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MATN4O95460 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MATN4O95460 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MATN4O95460 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MATN4O95460 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MATN4O95460 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MATN4O95460 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MATN4O95460 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MATN4O95460 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MATN4O95460 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MATN4O95460 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MATN4O95460 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MATN4O95460 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MATN4O95460 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MATN4O95460 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MATN4O95460 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MATN4O95460 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms