Protein–RNA interactions for Protein: O95394

PGM3, Phosphoacetylglucosamine mutase, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM3O95394 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGM3O95394 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGM3O95394 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGM3O95394 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGM3O95394 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PGM3O95394 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGM3O95394 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGM3O95394 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGM3O95394 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGM3O95394 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGM3O95394 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGM3O95394 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGM3O95394 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGM3O95394 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGM3O95394 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGM3O95394 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGM3O95394 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGM3O95394 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGM3O95394 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGM3O95394 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGM3O95394 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGM3O95394 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGM3O95394 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGM3O95394 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGM3O95394 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGM3O95394 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM3O95394 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM3O95394 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM3O95394 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGM3O95394 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGM3O95394 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGM3O95394 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM3O95394 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM3O95394 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM3O95394 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM3O95394 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM3O95394 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGM3O95394 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM3O95394 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM3O95394 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM3O95394 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGM3O95394 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGM3O95394 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM3O95394 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM3O95394 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM3O95394 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM3O95394 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM3O95394 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGM3O95394 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGM3O95394 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGM3O95394 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGM3O95394 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM3O95394 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM3O95394 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM3O95394 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM3O95394 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM3O95394 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM3O95394 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM3O95394 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGM3O95394 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGM3O95394 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGM3O95394 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM3O95394 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM3O95394 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM3O95394 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM3O95394 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM3O95394 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM3O95394 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM3O95394 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM3O95394 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM3O95394 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM3O95394 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM3O95394 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGM3O95394 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGM3O95394 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGM3O95394 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGM3O95394 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM3O95394 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM3O95394 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PGM3O95394 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM3O95394 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM3O95394 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM3O95394 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM3O95394 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM3O95394 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGM3O95394 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGM3O95394 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGM3O95394 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGM3O95394 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGM3O95394 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM3O95394 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM3O95394 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM3O95394 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms