Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP72O76094 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP72O76094 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP72O76094 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP72O76094 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP72O76094 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP72O76094 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP72O76094 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP72O76094 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP72O76094 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP72O76094 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP72O76094 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP72O76094 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRP72O76094 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRP72O76094 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRP72O76094 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRP72O76094 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP72O76094 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP72O76094 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP72O76094 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRP72O76094 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRP72O76094 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRP72O76094 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP72O76094 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP72O76094 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP72O76094 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRP72O76094 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRP72O76094 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRP72O76094 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRP72O76094 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRP72O76094 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SRP72O76094 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRP72O76094 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRP72O76094 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRP72O76094 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRP72O76094 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRP72O76094 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRP72O76094 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRP72O76094 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRP72O76094 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRP72O76094 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRP72O76094 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRP72O76094 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRP72O76094 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRP72O76094 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRP72O76094 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRP72O76094 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRP72O76094 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRP72O76094 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRP72O76094 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SRP72O76094 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRP72O76094 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRP72O76094 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRP72O76094 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRP72O76094 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRP72O76094 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRP72O76094 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRP72O76094 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRP72O76094 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRP72O76094 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRP72O76094 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRP72O76094 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRP72O76094 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRP72O76094 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRP72O76094 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRP72O76094 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRP72O76094 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRP72O76094 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRP72O76094 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRP72O76094 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRP72O76094 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRP72O76094 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRP72O76094 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRP72O76094 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP72O76094 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP72O76094 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP72O76094 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP72O76094 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP72O76094 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRP72O76094 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRP72O76094 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRP72O76094 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SRP72O76094 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRP72O76094 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRP72O76094 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SRP72O76094 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRP72O76094 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRP72O76094 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRP72O76094 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRP72O76094 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRP72O76094 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRP72O76094 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRP72O76094 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRP72O76094 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRP72O76094 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRP72O76094 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRP72O76094 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRP72O76094 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRP72O76094 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRP72O76094 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms