Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GABBR2O75899 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABBR2O75899 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABBR2O75899 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABBR2O75899 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABBR2O75899 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABBR2O75899 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GABBR2O75899 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GABBR2O75899 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABBR2O75899 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABBR2O75899 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms