Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC6AO75865 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC6AO75865 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6AO75865 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC6AO75865 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms