Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB3O75712 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB3O75712 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB3O75712 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB3O75712 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB3O75712 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB3O75712 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB3O75712 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB3O75712 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB3O75712 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB3O75712 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB3O75712 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB3O75712 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB3O75712 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB3O75712 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB3O75712 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB3O75712 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB3O75712 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB3O75712 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB3O75712 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB3O75712 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB3O75712 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB3O75712 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB3O75712 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB3O75712 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB3O75712 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB3O75712 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB3O75712 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB3O75712 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB3O75712 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB3O75712 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB3O75712 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB3O75712 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB3O75712 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB3O75712 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB3O75712 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB3O75712 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB3O75712 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB3O75712 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB3O75712 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB3O75712 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB3O75712 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB3O75712 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB3O75712 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB3O75712 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB3O75712 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB3O75712 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB3O75712 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB3O75712 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB3O75712 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB3O75712 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB3O75712 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB3O75712 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB3O75712 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB3O75712 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB3O75712 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB3O75712 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB3O75712 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB3O75712 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB3O75712 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB3O75712 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB3O75712 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB3O75712 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB3O75712 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB3O75712 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB3O75712 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB3O75712 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB3O75712 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB3O75712 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB3O75712 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB3O75712 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB3O75712 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB3O75712 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB3O75712 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB3O75712 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB3O75712 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB3O75712 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB3O75712 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB3O75712 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB3O75712 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB3O75712 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB3O75712 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB3O75712 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB3O75712 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB3O75712 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB3O75712 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB3O75712 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB3O75712 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB3O75712 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB3O75712 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB3O75712 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB3O75712 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB3O75712 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB3O75712 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB3O75712 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB3O75712 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJB3O75712 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB3O75712 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB3O75712 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB3O75712 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms