Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTRF1O75570 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1O75570 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1O75570 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1O75570 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms