Protein–RNA interactions for Protein: O75333

TBX10, T-box transcription factor TBX10, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX10O75333 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TBX10O75333 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TBX10O75333 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TBX10O75333 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TBX10O75333 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TBX10O75333 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TBX10O75333 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TBX10O75333 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TBX10O75333 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TBX10O75333 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TBX10O75333 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TBX10O75333 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TBX10O75333 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TBX10O75333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TBX10O75333 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TBX10O75333 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TBX10O75333 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TBX10O75333 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TBX10O75333 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TBX10O75333 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TBX10O75333 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TBX10O75333 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TBX10O75333 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TBX10O75333 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TBX10O75333 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TBX10O75333 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TBX10O75333 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TBX10O75333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TBX10O75333 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TBX10O75333 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TBX10O75333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TBX10O75333 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TBX10O75333 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TBX10O75333 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBX10O75333 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBX10O75333 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBX10O75333 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBX10O75333 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBX10O75333 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TBX10O75333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBX10O75333 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBX10O75333 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX10O75333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX10O75333 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX10O75333 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBX10O75333 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBX10O75333 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX10O75333 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX10O75333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX10O75333 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX10O75333 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX10O75333 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX10O75333 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX10O75333 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX10O75333 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBX10O75333 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBX10O75333 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBX10O75333 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX10O75333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX10O75333 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX10O75333 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX10O75333 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX10O75333 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX10O75333 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX10O75333 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX10O75333 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX10O75333 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX10O75333 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX10O75333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX10O75333 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX10O75333 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX10O75333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX10O75333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX10O75333 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX10O75333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBX10O75333 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBX10O75333 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBX10O75333 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX10O75333 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX10O75333 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX10O75333 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBX10O75333 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBX10O75333 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBX10O75333 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBX10O75333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX10O75333 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX10O75333 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX10O75333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX10O75333 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TBX10O75333 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TBX10O75333 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBX10O75333 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBX10O75333 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBX10O75333 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TBX10O75333 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TBX10O75333 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TBX10O75333 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TBX10O75333 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TBX10O75333 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBX10O75333 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms