Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SS18L1O75177 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SS18L1O75177 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SS18L1O75177 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SS18L1O75177 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SS18L1O75177 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SS18L1O75177 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SS18L1O75177 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SS18L1O75177 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SS18L1O75177 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SS18L1O75177 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms