Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM4AO75164 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM4AO75164 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
KDM4AO75164 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KDM4AO75164 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
KDM4AO75164 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
KDM4AO75164 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms