Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP5O60239 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5O60239 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP5O60239 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5O60239 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5O60239 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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