Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCO2O43819 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCO2O43819 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCO2O43819 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCO2O43819 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCO2O43819 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCO2O43819 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCO2O43819 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCO2O43819 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCO2O43819 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCO2O43819 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCO2O43819 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCO2O43819 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCO2O43819 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCO2O43819 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCO2O43819 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCO2O43819 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCO2O43819 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCO2O43819 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCO2O43819 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCO2O43819 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCO2O43819 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCO2O43819 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCO2O43819 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCO2O43819 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCO2O43819 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCO2O43819 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCO2O43819 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCO2O43819 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCO2O43819 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCO2O43819 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCO2O43819 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCO2O43819 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCO2O43819 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCO2O43819 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCO2O43819 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCO2O43819 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCO2O43819 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCO2O43819 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCO2O43819 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCO2O43819 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCO2O43819 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCO2O43819 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCO2O43819 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCO2O43819 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCO2O43819 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCO2O43819 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCO2O43819 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCO2O43819 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCO2O43819 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCO2O43819 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCO2O43819 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCO2O43819 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCO2O43819 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCO2O43819 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCO2O43819 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCO2O43819 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCO2O43819 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCO2O43819 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCO2O43819 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCO2O43819 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCO2O43819 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCO2O43819 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCO2O43819 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCO2O43819 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCO2O43819 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCO2O43819 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCO2O43819 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCO2O43819 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCO2O43819 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCO2O43819 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCO2O43819 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCO2O43819 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCO2O43819 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCO2O43819 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCO2O43819 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCO2O43819 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCO2O43819 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCO2O43819 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCO2O43819 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCO2O43819 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCO2O43819 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCO2O43819 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCO2O43819 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCO2O43819 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCO2O43819 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCO2O43819 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCO2O43819 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCO2O43819 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCO2O43819 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCO2O43819 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCO2O43819 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCO2O43819 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCO2O43819 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCO2O43819 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCO2O43819 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCO2O43819 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCO2O43819 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCO2O43819 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCO2O43819 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms