Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGTAO43765 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGTAO43765 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGTAO43765 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGTAO43765 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGTAO43765 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGTAO43765 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGTAO43765 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGTAO43765 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGTAO43765 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGTAO43765 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGTAO43765 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGTAO43765 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGTAO43765 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGTAO43765 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGTAO43765 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGTAO43765 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGTAO43765 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGTAO43765 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGTAO43765 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGTAO43765 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGTAO43765 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SGTAO43765 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGTAO43765 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SGTAO43765 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGTAO43765 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGTAO43765 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGTAO43765 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGTAO43765 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGTAO43765 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGTAO43765 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGTAO43765 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGTAO43765 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGTAO43765 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGTAO43765 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SGTAO43765 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGTAO43765 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGTAO43765 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGTAO43765 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGTAO43765 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGTAO43765 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGTAO43765 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGTAO43765 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGTAO43765 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGTAO43765 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SGTAO43765 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SGTAO43765 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGTAO43765 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGTAO43765 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGTAO43765 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGTAO43765 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGTAO43765 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGTAO43765 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms