Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX1O43435 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX1O43435 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX1O43435 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX1O43435 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX1O43435 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX1O43435 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX1O43435 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX1O43435 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX1O43435 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX1O43435 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX1O43435 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX1O43435 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX1O43435 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX1O43435 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX1O43435 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX1O43435 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX1O43435 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX1O43435 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX1O43435 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX1O43435 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX1O43435 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX1O43435 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBX1O43435 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBX1O43435 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBX1O43435 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBX1O43435 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBX1O43435 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBX1O43435 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBX1O43435 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBX1O43435 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBX1O43435 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBX1O43435 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBX1O43435 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBX1O43435 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBX1O43435 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBX1O43435 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBX1O43435 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX1O43435 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBX1O43435 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBX1O43435 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBX1O43435 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TBX1O43435 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBX1O43435 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBX1O43435 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBX1O43435 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBX1O43435 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBX1O43435 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBX1O43435 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBX1O43435 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBX1O43435 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBX1O43435 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TBX1O43435 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX1O43435 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX1O43435 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX1O43435 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX1O43435 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX1O43435 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX1O43435 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX1O43435 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX1O43435 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX1O43435 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX1O43435 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX1O43435 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX1O43435 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX1O43435 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX1O43435 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX1O43435 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX1O43435 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX1O43435 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBX1O43435 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX1O43435 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX1O43435 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX1O43435 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX1O43435 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX1O43435 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX1O43435 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX1O43435 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX1O43435 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX1O43435 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX1O43435 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX1O43435 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX1O43435 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBX1O43435 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX1O43435 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX1O43435 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX1O43435 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX1O43435 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX1O43435 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX1O43435 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX1O43435 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX1O43435 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX1O43435 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms