Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA5O15230 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA5O15230 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA5O15230 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA5O15230 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA5O15230 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms