Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SYNMO15061 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SYNMO15061 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SYNMO15061 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SYNMO15061 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SYNMO15061 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SYNMO15061 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SYNMO15061 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SYNMO15061 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
SYNMO15061 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SYNMO15061 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SYNMO15061 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SYNMO15061 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SYNMO15061 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SYNMO15061 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SYNMO15061 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNMO15061 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNMO15061 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNMO15061 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNMO15061 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNMO15061 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYNMO15061 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYNMO15061 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYNMO15061 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SYNMO15061 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SYNMO15061 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SYNMO15061 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SYNMO15061 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SYNMO15061 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYNMO15061 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SYNMO15061 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SYNMO15061 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SYNMO15061 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNMO15061 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNMO15061 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SYNMO15061 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYNMO15061 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYNMO15061 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYNMO15061 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SYNMO15061 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SYNMO15061 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SYNMO15061 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SYNMO15061 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYNMO15061 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYNMO15061 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYNMO15061 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYNMO15061 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SYNMO15061 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYNMO15061 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYNMO15061 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYNMO15061 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SYNMO15061 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SYNMO15061 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SYNMO15061 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYNMO15061 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNMO15061 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNMO15061 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNMO15061 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNMO15061 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYNMO15061 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYNMO15061 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYNMO15061 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYNMO15061 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SYNMO15061 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNMO15061 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNMO15061 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNMO15061 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SYNMO15061 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYNMO15061 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYNMO15061 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYNMO15061 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SYNMO15061 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SYNMO15061 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SYNMO15061 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SYNMO15061 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SYNMO15061 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
SYNMO15061 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SYNMO15061 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SYNMO15061 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SYNMO15061 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SYNMO15061 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SYNMO15061 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SYNMO15061 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYNMO15061 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYNMO15061 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SYNMO15061 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SYNMO15061 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SYNMO15061 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SYNMO15061 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SYNMO15061 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SYNMO15061 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
SYNMO15061 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SYNMO15061 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SYNMO15061 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SYNMO15061 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SYNMO15061 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SYNMO15061 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SYNMO15061 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SYNMO15061 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNMO15061 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms