Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZBTB39O15060 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ZBTB39O15060 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZBTB39O15060 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBTB39O15060 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZBTB39O15060 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZBTB39O15060 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZBTB39O15060 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBTB39O15060 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBTB39O15060 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms