Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKO14936 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKO14936 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKO14936 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKO14936 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKO14936 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKO14936 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKO14936 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKO14936 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKO14936 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKO14936 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKO14936 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKO14936 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKO14936 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKO14936 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKO14936 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKO14936 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKO14936 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKO14936 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKO14936 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKO14936 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKO14936 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKO14936 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKO14936 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKO14936 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASKO14936 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASKO14936 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASKO14936 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASKO14936 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASKO14936 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASKO14936 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASKO14936 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKO14936 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKO14936 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKO14936 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKO14936 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKO14936 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKO14936 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKO14936 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKO14936 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKO14936 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKO14936 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKO14936 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKO14936 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKO14936 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKO14936 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKO14936 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKO14936 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKO14936 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKO14936 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKO14936 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKO14936 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKO14936 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKO14936 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKO14936 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKO14936 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKO14936 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKO14936 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASKO14936 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKO14936 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKO14936 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKO14936 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKO14936 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKO14936 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKO14936 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKO14936 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKO14936 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASKO14936 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASKO14936 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKO14936 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKO14936 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKO14936 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKO14936 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKO14936 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKO14936 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKO14936 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKO14936 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKO14936 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKO14936 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKO14936 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKO14936 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKO14936 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKO14936 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASKO14936 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKO14936 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKO14936 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKO14936 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKO14936 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKO14936 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKO14936 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKO14936 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKO14936 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKO14936 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKO14936 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKO14936 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKO14936 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKO14936 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKO14936 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKO14936 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKO14936 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms