Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNK3O14649 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNK3O14649 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNK3O14649 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNK3O14649 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNK3O14649 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNK3O14649 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms