Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSO14618 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSO14618 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSO14618 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSO14618 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSO14618 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSO14618 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSO14618 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSO14618 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSO14618 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSO14618 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSO14618 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSO14618 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSO14618 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSO14618 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSO14618 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSO14618 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSO14618 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSO14618 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSO14618 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSO14618 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSO14618 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSO14618 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSO14618 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSO14618 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSO14618 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSO14618 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSO14618 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSO14618 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSO14618 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSO14618 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSO14618 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSO14618 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSO14618 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSO14618 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSO14618 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSO14618 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSO14618 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSO14618 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSO14618 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSO14618 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSO14618 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSO14618 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSO14618 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSO14618 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSO14618 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSO14618 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSO14618 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSO14618 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSO14618 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSO14618 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSO14618 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSO14618 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSO14618 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSO14618 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSO14618 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSO14618 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSO14618 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSO14618 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSO14618 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSO14618 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSO14618 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSO14618 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSO14618 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSO14618 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSO14618 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSO14618 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSO14618 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSO14618 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSO14618 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSO14618 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSO14618 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSO14618 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSO14618 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSO14618 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSO14618 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSO14618 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSO14618 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSO14618 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSO14618 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSO14618 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSO14618 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSO14618 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSO14618 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSO14618 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSO14618 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSO14618 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSO14618 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSO14618 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSO14618 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSO14618 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSO14618 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSO14618 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSO14618 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSO14618 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSO14618 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSO14618 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSO14618 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSO14618 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSO14618 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms