Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRDCB7Z8K6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDCB7Z8K6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDCB7Z8K6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDCB7Z8K6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDCB7Z8K6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms