Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPK3BL1B0FP48 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPK3BL1B0FP48 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPK3BL1B0FP48 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UPK3BL1B0FP48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPK3BL1B0FP48 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPK3BL1B0FP48 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPK3BL1B0FP48 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPK3BL1B0FP48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPK3BL1B0FP48 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPK3BL1B0FP48 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms