Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VGLL3A8MV65 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGLL3A8MV65 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VGLL3A8MV65 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VGLL3A8MV65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGLL3A8MV65 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms