Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A6NNZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NNZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NNZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A6NNZ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
A6NNZ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A6NNZ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A6NNZ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A6NNZ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
A6NNZ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NNZ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NNZ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NNZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NNZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A6NNZ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A6NNZ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A6NNZ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A6NNZ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
A6NNZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A6NNZ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A6NNZ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A6NNZ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A6NNZ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A6NNZ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A6NNZ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A6NNZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A6NNZ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A6NNZ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NNZ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A6NNZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A6NNZ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A6NNZ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A6NNZ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A6NNZ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NNZ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NNZ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
A6NNZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A6NNZ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NNZ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NNZ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A6NNZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NNZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NNZ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NNZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NNZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NNZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NNZ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NNZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NNZ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NNZ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NNZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NNZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NNZ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NNZ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2
A6NNZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A6NNZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A6NNZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A6NNZ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A6NNZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A6NNZ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A6NNZ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A6NNZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A6NNZ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A6NNZ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.54■■■□□ 2
A6NNZ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A6NNZ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A6NNZ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
A6NNZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
A6NNZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NNZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NNZ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NNZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A6NNZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A6NNZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
A6NNZ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A6NNZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A6NNZ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A6NNZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A6NNZ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A6NNZ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A6NNZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A6NNZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A6NNZ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A6NNZ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A6NNZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A6NNZ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A6NNZ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NNZ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NNZ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NNZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NNZ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NNZ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
A6NNZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A6NNZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NNZ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NNZ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NNZ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NNZ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NNZ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NNZ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms